Traditionnellement, le shiatsu se pratique au sol sur futon ou tatamis. Il est possible de le pratqiuer sur une chaise ergonomique afin d'adapter à la mobilité du receveur.

Des vêtements amples et confortables sont recommandés pour un confort optimal. Aucun produit n’est appliqué sur le corps. 

La durée d’une séance est d’une heure ou une heure trente. Elle est précédée d’un échange de 10 à 15 minutes sur l’état de santé du receveur, les raisons de la visites. Cela permet au Shiatsu-shi de répondre au mieux au besoin du receveur. Un moment est prévu pour échanger sur le ressenti après la séance.